Entrainée à l'heure actuelle par Stéphane Moreau, la section U19 du FC Nantes peut se targuer d'avoir à son palmarès trois titres de champion de France (1991, 2022, 2023). Lors de la saison 2023-2023, les jeunes canaris parviennent même à se hisser jusqu'en demi-finale de Youth League (Ligue des Champions des -19 ans). Aux portes de la Finale, les Jaunes et Verts se feront finalement éliminer par l'Olympiacos (0-0, 3-1 TAB). Dans son histoire, de nombreux joueurs professionnels sont passés par cette section. On retrouve notamment Randal Kolo Muani, Dimitri Payet, Léo Dubois. Aujourd'hui place à la relève avec Louis Leroux et Herba Guirassy qui ont signé leurs premiers contrats professionnels.
